Der Flughafen München umfasst mehrere Airports, wobei den größeren der heute noch betriebenen Flughäfen der Flughafen München Franz Josef Strauß darstellt. Dieser wurde 1992 als Nachfolger des Flughafen München-Riem gewählt und fertigt derzeit im Jahr rund 33 Millionen Passagiere ab. Somit ist er nach dem Flughafen Frankfurt Rhein-Main International das zweitgrößte Luftdrehkreuz Deutschlands. In Europa belegt er den siebten und weltweit den 30. Platz. Zwei Terminals stehen insgesamt zur Verfügung. Das Fluggelände erstreckt sich auf rund 1.620 Hektar, wobei ein Großteil für die derzeit zwei und bald drei Lande- bzw. Startbahnen zur Verfügung steht.

Der Betreiber ist die Flughafen München GmbH, welche fast 10.000 der rund 25.000 am Flughafen München Franz Josef Strauß arbeitenden Menschen beschäftigt. Er war bis vor kurzem auch am Flughafen Augsburg beteiligt, jedoch an keinem anderen zur Region München gehörendem Airport. Der Flughafen Memmingen, welcher hauptsächlich von der Billigfluggesellschaft Ryanair genutzt und von dieser als Flughafen München-West beworben wird, ist im Besitz der Allgäu Airport GmbH & Co. KG und befindet sich rund fünf Kilometer von Memmingen sowie mehr als 100 km von München entfernt. Shuttle-Busse verbinden den Airport mit der bayrischen Landeshauptstadt kostengünstig und regelmäßig. Den Betriebe erstmals aufgenommen hat der Flughafen München-West bzw. Memmingen 1936. Nach Jahrzehnter langer Betriebsunterbrechung, landeten und starteten die ersten Flieger nach der Jahrtausendwende im Jahre 2004 wieder.

Neben dem Flughafen München Franz Josef Strauß und Memmingen gehören auch einige Flugplätze und Militärflughäfen zur Millionenmetropole bzw. ihrer Metropolregion. Zu nennen ist primär hierbei der Flugplatz Schleißheim, der bereits 1912 gebaut und nach dem zweiten Weltkrieg jahrelang vom US-amerikanischen Militär genutzt wurde. Heute steht er rund sechs Luftsportvereinen zur Verfügung. Der jahrelang militärisch genutzte Flughafen München Neubiberg hat heute seinen Betrieb komplett eingestellt und galt früher für die Nationalsozialisten, ebenso wie für die anschließend am Wiederaufbau der Bundesrepublik beteiligten Westalliierten als strategisch wichtiger Kriegsführungs- bzw. Organisationspunkt.